空分设备在两次大加热之间的运转周期长短与很多因素有关，从操作的角度，主要取决于主换热器的空气通道何时被堵塞。而堵塞的主要原因是进装置的空气中的水分、二氧化碳的含量超标(对水分要求露点低于-65℃，二氧化碳含量小于1×10-6)，在主换热器内积累、冻结，直至堵塞。
分子筛净化系统操作不正常，会缩短装置的运转周期。主要由以下几方面原因引起的：
1)分子筛吸附器床层短路。在开车过程中由于空气气速控制不稳，或切换时两罐压差过大，会对床层产生冲击，使分子筛床层凹凸不平，造成床层短路。严重时会将吸附器的防尘网冲破，将分子筛粉末带进换热器通道，造成堵塞；
2)喷淋冷却塔带水。空气通过喷淋冷却塔的气速过大，将水雾带进吸附器，使吸附器清除水的负荷大大增加，出口空气中的水分、二氧化碳的含量超标，带入主热交换器而产生冻结，使阻力增大。如果是冷段的阻力增大，则是二氧化碳冻结；如果是热段阻力增大，则是水分冻结；整个换热器阻力增大，则二者都冻结，或是分子筛粉末堵塞；
3)冷冻机工作不正常，造成冷冻水温度升高，空气不能冷却到正常的温度。一方面使得空气离开喷淋塔时的饱和水含量增加；另一方面使得分子筛的吸附能力下降；
4)喷淋塔断水或水位过高，将造成分子筛吸附器温度升高，或产生带水事故。
