1、腹腔腹水：腹部膨胀的传染性鱼病剖检大多数可见腹腔腹水，或透明或混作或血红。如传染性胰腺坏死病、斑点叉尾鮰病毒病、鲑疱疹病毒病、牙鲆弹状病毒病、病毒性出血病败血症、鳜鱼彩虹病毒病，因细菌感染也可引起其腹腔腹水。
2、贫血：产生溶血素的细菌感染症和血液寄生虫寄生克造成溶血性贫血。出血性疾病可造成出血性贫血。发生出血性贫血的疾病主要是病毒性疾病，包括草鱼出血病、虹鳟病毒性败血症、鲤春病毒病等。感染吸血性寄生虫如水蛭，可造成同样疾病。营养缺乏(如叶酸不足、缺乏铁质和维生素B12贫血症)、放射性污染、造血组织坏死、抗造血药物(如磺胺)的使用可造成发育不全贫血症。贫血病鱼鳃呈苍白色，脾脏发生肿大，部分或全部内部器官颜色苍白，有时有腹水。
3、内脏器官的白色结节：许多种细菌感染症在内脏器官形成肉芽肿，多由细菌性感染引起。真菌类的霍氏鱼醉菌以及球虫(艾美球虫)、粘孢子虫(如角形虫)、线虫绦虫等感染皆可形成白色结节或包囊。
4、内脏器官的浅黄色结节：某些抗酸细菌和液化肠杆菌及微孢子虫、孢子虫、复殖吸虫等可在内脏器官形成黄色结节。肝癌在肝脏也形成黄色结节。
5、内脏器官的潮红结节：线虫类如胃瘤线虫、嗜子宫线虫等可在内脏器官表面或内部形成红色结节。此外，剖检是经常咳在鱼腹腔中见到呈白色团块状的绦虫幼虫。
6、内脏组织充血或出血：内脏组织充血或出血是细菌感染的普遍症状，如嗜水气单胞菌、杀鲑气单胞菌、芽孢杆菌等，一般均由细菌性疾病引起。
7、内脏器官液化：一般均由细菌性感染引起。
8、肝脏的可见病变：
(1)肝肿大：细菌感染(如嗜水气单胞菌、爱德华氏菌)病毒感染、中毒、维生素缺乏、长期处于低溶解氧中、饲喂腐败的饲料等。
(2)白肝：病毒性感染如传染性胰腺坏死病、鳜鱼病毒病以及产生溶血素细菌感染、寄生虫性贫血症的病鱼肝脏呈白色。
(3)淤血肝：大多数细菌感染克造成肝脏局部或全肝淤血，使肝脏呈暗红色。
(4)绿肝：气单胞菌、假单胞菌感染以及胆道阻塞克使肝脏变成绿色。
(5)黄肝：类脂质变性以及细菌感染(如假单胞菌)克使肝脏呈黄色。鞭毛虫、孢子虫、感染。
(6)花斑肝：传染性胰腺坏死病、传染性造血器官坏死病、鲤春病毒症。和一些细菌感染。真菌感染、重金属和藻类中毒素等亦可造成肝坏死。
(7)肝的黑斑点：某些真菌感染如外瓶霉的感染症可在鱼肝脏形成黑色斑点。
9、肠道的可见病变
(1)胃膨胀或积水：细菌性感染较为常见，发病鱼胃部庞大，剖检胃壁变薄，胃
内充满液体，该症状的出现常与饵料有关。
(2)肠胃炎：病毒和细菌感染可造成胃肠发炎、充血、肿胀，后期肠粘膜脱落或坏死肠道内充满个色液体。细菌感染较为常见，寄生虫疾病也可引起肠炎。
10、鳔的课件病变：病毒、细菌、寄生虫均可造成鳔发炎、肿胀和积水。
11、肌肉组织的可见病变：
(1)肌肉中的结节：剖检病鱼是经常咳在肌肉发现各种结节或包囊，如孢子虫、微孢子虫等寄生虫。
(2)肌肉组织点状充血、淤血或瘀斑：病毒性疾病如病毒性出血性败血症以及细菌感染如气单胞菌、。爱德华氏菌等在成肌肉组织点状充血、淤血克造成肌肉组织大面积充血。
(3)肌肉组织中的起泡：迟缓爱德华氏菌可感染多种鱼类，在不同患病鱼中症状不同。斑点叉尾鮰发生此病的症状是体侧及尾柄肌肉组织糜烂，病灶处因腐烂而充满气泡、肿大，并伴有难闻的恶臭，故有气肿性腐烂病之称。
(4)肌肉浑浊：多由细菌性感染，寄生虫寄生所引起。
