益生菌，又称为益生素、微生态制剂或活菌制剂。指有利于维持肠道内的微生态平衡的微生物及其代谢产物，其可通过进入并定植于宿主的消化道，促进肠道有益微生物的繁殖，抑制有害微生物生长，调节宿生肠道菌群平衡，从而改善宿主的健康。益生菌对宿主的作用属于生物修复的范畴。
因此，益生菌应具备以下条件：
（1）必须对宿主无害；
（2）被宿主摄入后，可定植于消化道内并发挥作用；
（3）在人工感染的实验中，必须能提高宿主的抵抗力。
1、益生菌的作用机理
分泌作用：通过分泌细菌素、胞外酶等物质，抑制或杀灭有害细菌。
竞争作用：通过分泌抑制性物质，竞争营养物质，竞争宿主的定植位点或通过竞争排斥的原理，抑制有害细菌的生长繁殖。
提高水产动物的免疫力：通过提高抗体水平和巨噬细胞的活动，激活机体体液和细胞免疫系统从而提升宿主的免疫能力。
净化改良水环境：通过直接或间接的分解和利用养殖水体中的有机物质，减少氨氮、亚硝酸盐的含量，抑制有害细菌滋生，改善水体环境，促进水产动物的健康生长。
2、益生菌在水产养殖中的应用
水产动物生活在水环境中，其体内微生物组成除了受自身机体内在因素的影响，还易随着来自外界环境与食物中的微生物入侵而发生改变。为了有效地对水产动物疾病的进行防治，可以采用外界添加益生菌的手段实现改善水产动物生存的环境，平衡体内的微生物群落的组成，增强水产动物对病原菌的抵抗能力，提高养殖成功率的目的。
分类
在水产养殖过程中，益生菌常作为生长促进剂、免疫促进剂、治疗剂、水质改良剂进行实际应用，根据菌种不同来区分，常用的益生菌有光合细菌、芽孢杆菌、乳酸菌、酵母菌、蛭弧菌、硝化细菌等。
1、光合细菌
光合细菌，属于厌氧或兼性厌氧性的光能异养菌。在光照条件下，光合细菌能利用小分子有机物合成自身生长繁殖所需要的各种养分，增加水体溶氧，还能利用水环境中的氨氮、硝酸盐、亚硝酸盐等合成有机氮化物，净化水质；在缺氧条件下，光合细菌对硫化氢、酸性物质等均有一定的分解作用。此外，光合细菌可以产生抗病毒因子等生物活性物质，具有独特的抗病、促生长功能，大大提高了水产动物的生产性能的优点。
使用注意事项：
（1）光合细菌制剂多为液态，使用时无需活化，应选在晴天上午使用，低温及阴雨天不宜使用；
（2）水肥或水质恶化时，宜使用光合细菌分解有机污染物，改善水体环境；水瘦时要先施肥再使用光合细菌；
（3）由于酸性水体不利于光合细菌生长，使用光合细菌前应先泼洒适量生石灰调节水体pH至6.0-8.0。
2、芽孢杆菌
芽孢杆菌，是一种可形成芽孢的好氧革兰氏阳性菌，具有耐酸、耐盐、耐高温、快速复活和可分泌多种能降解有机物的酶类（蛋白酶、淀粉酶、脂肪酶）等特点，不仅能有效抑制宿主肠道有害病菌生长，提高机体抗病能力，还可能直接利用水体中的硝酸盐和亚硝酸盐，分解池底有机物，降低养殖水体富营养化程度，优化水体环境。常见的有枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、短小芽孢杆菌等。
使用注意事项：
（1）芽孢杆菌是好氧性细菌，应在晴天使用，泼洒时必须开启增氧机，增加溶氧，使其在水体繁殖迅速形成种群优势；
（2）芽孢杆菌制剂多为粉状产品，以休眠孢子的形式存在，使用前必须打氧发酵6-8小时进行活化、增殖，提高芽孢杆菌的使用效率。
3、乳酸菌
乳酸菌，属于厌氧或兼性厌氧菌，能够分解碳水化合物，主要代谢产物为乳酸，可降低肠道pH，抑制肠道不耐酸厌氧病原菌繁殖，维持肠道微生态平衡，还可合成短链脂肪酸和B族维生素，中和毒性产物，抑制氨和胺的合成，增强机体免疫力。
使用注意事项：
（1）乳酸菌使用时可用红糖水活化增殖，提高乳酸菌使用效率；
（2）使用乳酸菌拌料应间歇性进行，长期连续使用易导致虾肠道酸度过高，肠壁变薄，影响饲料消化吸收。
4、酵母菌
酵母菌，是一种单细胞真菌，属于兼性厌氧菌，在有氧的情况下，它把糖分解成二氧化碳和水且酵母菌生长较快。在缺乏氧气时，发酵型的酵母通过将糖类转化成为二氧化碳和乙醇（俗称酒精）来获取能量。酵母菌适宜生长在多糖偏酸环境中，体内富含蛋白质和多种B族维生素，不耐热。酵母及其培养物可有效地改善胃肠内环境和菌群结构，促进营养质消化吸收，抑制病原菌繁殖，提高机体抗病能力，提高水产动物品质，是一种绿色饲料添加剂。
使用注意事项：
（1）酵母菌适宜在偏酸水体中生长，使用前应先调节水体pH；
（2）酵母菌在有氧的情况下生长较快，应选晴天上午使用，且开动增氧机，增加水体溶氧。
5、蛭弧菌
蛭弧菌，是一类非常微小的寄生型革兰氏阴性细菌，主要通过粘附、攻击、侵染、裂解其他细菌的方式使自身得以生长繁殖，有类似噬菌体的作用。其能够裂解大多数科，属革兰氏阴性细菌，并对许多的致病菌都有良好的裂解活性。目前分离的噬菌蛭弧菌菌株对pH、温度等环境因子的要求并不严格，其噬菌条件范围一般为pH6.5-8.6和4℃-37℃。
使用注意事项：
蛭弧菌生长、侵染及裂解有害细菌的过程通常为3-7天，因此，蛭弧菌的使用应做好计划，提前5-10天使用，有效发挥其抑菌效果。
6、硝化细菌
硝化细菌，是指利用氨或亚硝酸盐作为主要能源以及能利用二氧化碳作为主要碳源的细菌，属于化能自养型细菌，可分为亚硝化细菌和硝化细菌两大类群。硝化细菌在氮的循环中将亚硝酸盐转化为硝酸盐而被藻类利用，从而起到净化水质的作用。
使用注意事项：
（1）硝化细菌制剂多为液态产品，使用时无需活化、扩培，直接稀释泼洒即可；
（2）硝化细菌的繁殖速度较慢，泼洒后4-5天才可见明显效果，应提前5-7天施用，
（3）硝化作用是耗氧的过程，使用硝化细菌时应开动增氧机，增加水体溶氧量，但是，硝化细菌不可与氧化性较强的化学增氧剂（如过碳酸钠、过氧钙等。）同时使用。
