芽孢杆菌和光合细菌
芽孢类型的产品水产上用的是最多也最广泛，这并不是因为芽孢一定比光合好，这是为什么呢，从2个角度来看：
生产者的角度：芽孢杆菌产生孢子容易，好保存好运输，关键是产生孢子的工艺简单成本低，只要是稍微有生物技术的人再加上设备，随便就可以投办一个厂，注册一个商品，生产产品。
养殖户的角度：活化使用简单，买来产品以后，打开包装，加水活化就可以，大部分正规厂家的产品说明都是要求加水活化的，而且是要求充气活化。在这两点上，光合细菌是完败的，所以市场上光合的占有率以及普及程度都没有芽孢高。
对于商家，生产出光合来是非常简单的甚至比芽孢更简单，关键是保存，这个和活藻的保存是一样的，如果是直接以液体活菌的方式保存，其活力从出厂到使用的这一段时间，随着时间的延长，其活力会降低到非常微弱，这点，我做过实验，选不同品牌的商品菌做种源，接种在合适的培养基和条件下培养，有的品牌无法培养起来，有的则是经过长达半个月的时间才生长起来，那么这个时候有人就会说，某某品牌的光合细菌非常的好，5公斤的一桶40元，一亩用1公斤下去藻类马上死了，水变清了，嘿嘿，你见到的是水变清了，藻类也确实死了，但是你以为你用的就是真正的光合细菌？因为他是大品牌，所以你深信不疑不信，你做实验，看你用的这种，能不能在光合培养基上面培养起来？？
最近有人说，他们那边有一种光合细菌的冻干粉，15元一包一公斤，且不说光合的冻干保存性能有多提高，也不说冻干保存成本有多高，我只想告诉大家一个事实，一吨高浓度液体光合细菌才有3公斤粉状光合细菌。
于养殖户来讲，大部分的养殖户用什么产品都是有市场决定的，市场则是由商家决定的。从这点来说光合细菌当然就无法被广大的养殖户所接受，其二，自己做培养基培育光合，确实是比较繁琐，不比芽孢那么来的简单。
EM菌
说到这个EM菌，如果单从调水的作用上，我是不会提到他的，说到他，不是因为他真正多有用，而是他确实就像神话一样笼罩在很多养殖户心头，不过这个神话是由市场编造的，真正的好的EM菌在内服的功能是不可否定的，特别是在家畜养殖上，但是也绝对没有神话中说的那么厉害，我想这点用过他的养殖户最有发言权。那么在水产调水上，我想说的是，调水要的是活菌，EM菌到底是活菌还是活菌产物，有人说是由芽孢，酵母，放线菌、光合，乳酸等等几十种活菌组成的呢，嘿，你怎么知道的，你一定是百度到的吧，呵呵，多去学习下生物知识吧。每一种类型的细菌都有不同要求的条件，比如芽孢需要氧气，光合需要光能，放线菌光合菌适应偏碱性条件，乳酸酵母适应偏酸性，而且各种细菌之间的拮抗作用更是复杂多元，大家对照下，现在很多的所谓的EM都是教大家，简单的用种加红糖密封发酵，嘿嘿，真是太幼稚了，真正的EM菌，确切的说是活菌代谢产物，而不是活菌。
那么这个时候一定又有同学说，某某品牌的EM菌、乳酸菌，用于水体，用量少，效果好，这个时候，我又想说，你以为的你以为。
乳酸菌、酵母菌
就不说了，和EM一样内服功能强大，至于调水作用，了解下污水处理方面的知识，你看有没有哪个数据资料显示，用这些菌做生物污水处理的。再就是你去了解下这有没有哪个是从水体环境去富集分离这2种菌的。从这点可以说明，乳酸和酵母于水体的定植力是非常微弱的。
芽孢和光合调水的功能和特性
简单来说，芽孢来的快去的也快，光合来的慢，但是维持持久，于水体的定值力比芽孢要强，为什么这么说呢，两者其实都是水体中的原始土著菌，都可以从池塘水体环境中富集到，但是两者的区别就在于，芽孢典型的异养菌，对水体营养条件要求高，所以当池塘富营养化条件理想的时候，大量的芽孢杆菌繁殖和代谢有机物和耗费氧气，净水的时候，其水体可被芽孢利用的营养物质也被消耗殆尽，这个时候，芽孢会以孢子的形式出现，孢子是没有任何净水力的，所以说，芽孢来的快去的也快，而光合则是典型的光能自养生物加兼性生物，是一类以光作为能源、能在厌氧光照或好氧黑暗条件下利用自然界中的有机物、硫化物、氨等作为供氢体兼碳源进行光合作用的微生物。光合和藻类的生态位置很接近，由于对养分的要求相对宽松，（光、无机养分、无光、有机养分）所以能很好的以活菌的形式而且光合也必然是活菌的形式定植于池塘。
对于使用后的效果，两者之间也是不同的
芽孢作用于有机质积累多的池塘迅速转化有机物为无机养分，（大部分的异养菌代谢过程都是这样），这时水体无机养分迅速升高，透明度会有所变高，此时如果水体藻类基础良好，天气也正常，那么水会迅速变肥，其实先不要定论是否变肥，只能说藻类大量生长，水质变浓，如果是有益于鱼类增值的藻类可以说是变肥，反之，则只能说变浓。如果此时水体藻类基础差，或是下菌后又恰好遇到阴雨天，那么此时，必然会氨氮亚盐升高，如果不开增氧，水质会更加不适应鱼类生长，所以也是为什么有的养殖户用了芽孢发生死鱼。即是偶然也是必然。
光合用于水体以后，如果是养殖前期，池塘的积累不多或是上年的积累物质水温没有起来，没有被释放，这个时候用光合以后特别是大量用以后，和藻类争夺营养，藻类会很快被抑制，迅速把水变清，这点绝对不是我们养殖户所喜欢的结果，所以说，前期用光合，可以少量，或是和结合无机肥一起使用，和无机肥配合使用是比较好的途径，可以把简单的廉价的肥料转化为营养丰富的浮游生物，对杂食性特别是滤食性鱼类。单独的无机肥往往只是把水变浓，而不是真正的变肥。那么，养殖中后期，特别是精养池塘，池塘每日投入变多，加上池塘底部大量的积累物质在温度起来以后迅速被异养菌分解释放为无机养分，这个过程就和芽孢分解转化过程是一样的了，这个时候用光合，量就可以适当加大，至于还需不需要配合无机肥，就要看实际情况，灵活掌握了。
最后，本着一个从事养殖一线的我，告诉大家，不要想今天用这个菌，明天又用那个菌，就普通调水来说，坚持用好芽孢或是光合就够了，你看哪个省钱就用哪个，普通养殖一定要控制成本，减少折腾。好多的养殖户就是喜欢瞎折腾。累了人不说更赚不到钱。
