对此，中国工程院院士、清华大学教授金涌在近日接受记者采访时提出，煤制油不仅能源转化效率低下、产业链短、应对市场变化的能力差，而且面临的环保压力日益增大，只可作为一种应对石油危机的战略性技术储备，在政治和战略高度上加以重视，近期或中远期都不宜盲目放大产能，更不能将其做为拉动GDP的产业来做。否则，企业将付出资源浪费和环境污染的代价，并承受巨大的投资风险。
资源风险： 能源转化效率低
据记者了解，目前已经获得国家发改委批准、得到“路条”或即将得到“路条”的有神华宁煤、伊泰集团、山西潞安，以及兖矿延长榆林四个煤制油项目，合计880万吨/年，这些项目全部计划在“十二五”期间建成投产。面对这股煤制油热，金涌表示：“煤经不同方式转化后，可以获得石油化工所能生产的一切产品，但就能源转化效率来看，煤制油无疑是最低的，绝不能作为煤化工的首选。”
他以国内目前已经工业化运行的煤转化装置的实际数据进一步解释，采用费托合成工艺生产油品（即煤间接制油），1吨标准煤（热值为29.3吉焦，下同）可获得266千克柴油，燃烧后得到11.87吉焦热量。若将这些油品用做柴油车燃料，按目前柴油发动机能量转化效率30%计算，可获得3.56吉焦的轴机械功。同理，1吨标煤直接液化可获得263千克柴油，最终只能转换为3.3吉焦轴机械功。
1吨标煤，如果生产天然气，则可获得460立方米甲烷，燃烧后得到16.56吉焦热量。这些甲烷用作汽车燃料，可转换为超过4.7吉焦的轴机械功。若生产甲醇，可获得698千克甲醇，燃烧可获得15.82吉焦热量，用作汽车燃料可获得4.13吉焦轴机械功（按汽油发动机26%效率计算）。若生产二甲醚，则可得到465千克产品，用作柴油车燃料，可产生3.99吉焦的轴机械功。若用于超超临界发电，可获得13.2吉焦电能，再按电机效率70%推算，可转换为9.24吉焦轴机械功。
“显而易见，如果目标产品是车用动力燃料，那么，煤制油的能量转化效率和资源利用效率不仅无法与煤发电相提并论，甚至与煤制甲醇、煤制二甲醚、煤制天然气相比也很逊色。”金涌说。
环境风险： CO2排放量巨大
另外，煤制油的二氧化碳排放量和耗水量，也是新型煤化工中最高的。如果说耗水量巨大的问题可以通过空冷、废水处理回用等途径得到缓解的话，煤制油巨大的二氧化碳排放量，将成为其未来发展的最大制约因素。
目前，二氧化碳处理与利用技术虽然有所突破，但成熟可靠、经济可行，且无安全隐患的工业化技术凤毛麟角，预计三五十年，甚至上百年时间内，人类都无法借助技术的突破，实现二氧化碳的产生量与利用量持平。中国以煤炭为主要能源，面临的碳减排任务比其他任何国家都要艰巨，未来定会收紧对高排碳项目的管制。因此，煤制油将面临越来越大的环保与政策成本。
投资风险： 产业链延伸能力差
从终端产品和综合效益看，煤制油只能获得柴油、少量汽油、液化气以及副产物硫黄和煤焦油等有限的产品。煤制成甲醇后，则可生产烯烃、聚四甲撑醚二醇、γ-羟基丁酸内酯、四氢呋喃、1,4-丁二醇、聚甲醛、聚乙烯醇、乙烯醋酸乙烯共聚物（EVA）、聚对苯二甲酸丁二醇酯（PBT）、醋酸乙烯、醋酸酯、甲醇蛋白、醋酸、脲醛树脂、白乳胶、二甲醚等上百种产品。这些产品的衍生物加起来更有成千上万种，广泛用于工业、农业、商业、建筑、国防、海洋以及民生等各个领域，且随着产业链的延伸，产品附加值不断提高，对经济发展、社会就业等各方面的贡献越来越大，其社会综合效益远远大于煤制油带来的效益。
不仅如此，随着页岩气、煤层气、油砂、致密气等非常规油气资源的大面积开发利用，以及核能、太阳能、风能、生物质能等清洁可再生能源规模的扩大，世界化石能源的供需状况已经并将继续得到改善，石油价格走低或大幅波动的可能性将长期存在，煤制油项目面临的财务与市场风险也越来越大。